Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD8Q15843 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD8Q15843 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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