Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms