Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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