Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PCOLCEQ15113 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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