Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TRAM2Q15035 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TRAM2Q15035 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms