Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
LAPTM4AQ15012 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms