Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHD4Q14839 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms