Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMC1AQ14683 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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