Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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