Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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