Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SEMA3FQ13275 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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