Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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