Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PRDM2Q13029 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PRDM2Q13029 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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