Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXC1Q12948 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXC1Q12948 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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