Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms