Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CENPFP49454 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CENPFP49454 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CENPFP49454 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CENPFP49454 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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