Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPREP23469 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPREP23469 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms