Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRDP23468 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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