Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CRXO43186 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CRXO43186 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms