Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LINC00587B1AMM8 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms