Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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SNX13Q9Y5W8 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SNX13Q9Y5W8 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SNX13Q9Y5W8 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SNX13Q9Y5W8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SNX13Q9Y5W8 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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