Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN8Q9UBY8 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms