Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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RABGGTAQ92696 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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