Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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