Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms