Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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