Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA4Q16363 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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LAMA4Q16363 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LAMA4Q16363 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA4Q16363 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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