Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ALX1Q15699 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALX1Q15699 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms