Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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