Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PUM3Q15397 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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