Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBE3CQ15386 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms