Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RAB35Q15286 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms