Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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