Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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COL9A2Q14055 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
COL9A2Q14055 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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