Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCINQ13939 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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