Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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