Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL1Q13616 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL1Q13616 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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