Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SGCGQ13326 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms