Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIN2BQ13224 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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GRIN2BQ13224 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GRIN2BQ13224 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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GRIN2BQ13224 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIN2BQ13224 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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