Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms