Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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NR1H3Q13133 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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NR1H3Q13133 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NR1H3Q13133 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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