Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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GPS1Q13098 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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