Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RBBP4Q09028 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms