Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms