Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CASQ1P31415 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CASQ1P31415 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CASQ1P31415 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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