Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PTPRDP23468 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRDP23468 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRDP23468 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRDP23468 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PTPRDP23468 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPRDP23468 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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