Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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