Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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FOXQ1Q9C009 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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