Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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ZBED3Q96IU2 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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