Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC93Q567U6 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC93Q567U6 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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